Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dhx40Q6PE54 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dhx40Q6PE54 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dhx40Q6PE54 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dhx40Q6PE54 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Dhx40Q6PE54 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dhx40Q6PE54 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dhx40Q6PE54 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms