Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prrt3Q6PE13 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prrt3Q6PE13 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prrt3Q6PE13 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms