Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3bQ6PDC0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rundc3bQ6PDC0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms