Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q6PD19 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q6PD19 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q6PD19 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q6PD19 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q6PD19 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q6PD19 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q6PD19 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q6PD19 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q6PD19 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q6PD19 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q6PD19 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q6PD19 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q6PD19 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q6PD19 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q6PD19 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q6PD19 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q6PD19 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q6PD19 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q6PD19 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q6PD19 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q6PD19 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q6PD19 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q6PD19 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q6PD19 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q6PD19 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q6PD19 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q6PD19 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q6PD19 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q6PD19 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Q6PD19 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q6PD19 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q6PD19 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q6PD19 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q6PD19 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q6PD19 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Q6PD19 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q6PD19 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q6PD19 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q6PD19 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q6PD19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q6PD19 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q6PD19 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q6PD19 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q6PD19 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q6PD19 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q6PD19 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q6PD19 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q6PD19 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q6PD19 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q6PD19 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q6PD19 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q6PD19 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q6PD19 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q6PD19 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q6PD19 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q6PD19 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q6PD19 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q6PD19 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q6PD19 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q6PD19 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q6PD19 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q6PD19 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q6PD19 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q6PD19 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q6PD19 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q6PD19 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q6PD19 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q6PD19 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q6PD19 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q6PD19 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q6PD19 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q6PD19 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q6PD19 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q6PD19 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q6PD19 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q6PD19 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q6PD19 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q6PD19 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q6PD19 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q6PD19 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q6PD19 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q6PD19 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q6PD19 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q6PD19 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q6PD19 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q6PD19 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q6PD19 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q6PD19 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q6PD19 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms