Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCW6

Cnfn, Cornifelin, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnfnQ6PCW6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CnfnQ6PCW6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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CnfnQ6PCW6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CnfnQ6PCW6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms