Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Zbtb40Q6PCS8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Zbtb40Q6PCS8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbtb40Q6PCS8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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