Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AtminQ6P9S1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AtminQ6P9S1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AtminQ6P9S1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms