Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smchd1Q6P5D8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smchd1Q6P5D8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Smchd1Q6P5D8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
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