Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RbfaQ6P3B9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RbfaQ6P3B9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RbfaQ6P3B9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RbfaQ6P3B9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms