Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Capn11Q6J756 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Capn11Q6J756 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Capn11Q6J756 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms