Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sh3rf1Q69ZI1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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