Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atg9aQ68FE2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Atg9aQ68FE2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atg9aQ68FE2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atg9aQ68FE2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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