Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup62Q63850 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nup62Q63850 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup62Q63850 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms