Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufa4Q62425 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufa4Q62425 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufa4Q62425 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms