Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Itga6Q61739 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Itga6Q61739 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Itga6Q61739 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga6Q61739 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms