Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim25Q61510 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim25Q61510 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim25Q61510 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms