Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp13a3Q5XF89 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp13a3Q5XF89 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp13a3Q5XF89 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms