Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCQ5

Dph1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph1Q5NCQ5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dph1Q5NCQ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dph1Q5NCQ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dph1Q5NCQ5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms