Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim58Q5NCC9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim58Q5NCC9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim58Q5NCC9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim58Q5NCC9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms