Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prkaa1Q5EG47 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prkaa1Q5EG47 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prkaa1Q5EG47 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms