Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Znf608Q56A10 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Znf608Q56A10 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Znf608Q56A10 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Znf608Q56A10 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Znf608Q56A10 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms