Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fam228bQ497Q6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam228bQ497Q6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Fam228bQ497Q6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam228bQ497Q6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms