Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al1nQ497L1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1nQ497L1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1nQ497L1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms