Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc110Q3V125 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc110Q3V125 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc110Q3V125 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms