Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Garnl3Q3V0G7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Garnl3Q3V0G7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Garnl3Q3V0G7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms