Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp48Q3V0C5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp48Q3V0C5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp48Q3V0C5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp48Q3V0C5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms