Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim15Q3UTD9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smim15Q3UTD9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smim15Q3UTD9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms