Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BB287469Q3UT53 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms