Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc33Q3ULW6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc33Q3ULW6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms