Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plxnd1Q3UH93 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Plxnd1Q3UH93 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Plxnd1Q3UH93 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms