Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdhd2Q3UGR5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdhd2Q3UGR5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms