Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5113Q3UGK8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5113Q3UGK8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5113Q3UGK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms