Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Rnf149Q3U2C5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf149Q3U2C5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Rnf149Q3U2C5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnf149Q3U2C5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Rnf149Q3U2C5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf149Q3U2C5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rnf149Q3U2C5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnf149Q3U2C5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rnf149Q3U2C5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf149Q3U2C5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf149Q3U2C5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnf149Q3U2C5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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