Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Shcbp1lQ3TTP0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Shcbp1lQ3TTP0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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