Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdpd4Q3TT99 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gdpd4Q3TT99 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdpd4Q3TT99 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms