Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fubp3Q3TIX6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fubp3Q3TIX6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fubp3Q3TIX6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fubp3Q3TIX6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms