Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc13Q3TIR1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc13Q3TIR1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc13Q3TIR1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms