Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfp444Q3TDV8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Zfp444Q3TDV8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zfp444Q3TDV8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zfp444Q3TDV8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms