Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
V1rd19Q3KNP5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
V1rd19Q3KNP5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
V1rd19Q3KNP5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms