Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd3Q14AI6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd3Q14AI6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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