Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cib3Q0P523 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cib3Q0P523 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms