Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MitfQ08874 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MitfQ08874 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MitfQ08874 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MitfQ08874 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MitfQ08874 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MitfQ08874 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MitfQ08874 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms