Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scg2Q03517 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scg2Q03517 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scg2Q03517 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms