Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apoa1Q00623 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa1Q00623 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa1Q00623 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms