Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stx2Q00262 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
Stx2Q00262 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx2Q00262 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx2Q00262 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx2Q00262 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stx2Q00262 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx2Q00262 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stx2Q00262 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx2Q00262 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx2Q00262 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx2Q00262 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx2Q00262 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx2Q00262 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stx2Q00262 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx2Q00262 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx2Q00262 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx2Q00262 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx2Q00262 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx2Q00262 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stx2Q00262 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stx2Q00262 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stx2Q00262 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx2Q00262 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stx2Q00262 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx2Q00262 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx2Q00262 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx2Q00262 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Stx2Q00262 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stx2Q00262 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx2Q00262 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx2Q00262 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stx2Q00262 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stx2Q00262 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stx2Q00262 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms