Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VldlrP98156 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VldlrP98156 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VldlrP98156 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VldlrP98156 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VldlrP98156 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VldlrP98156 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VldlrP98156 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms