Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbbp6P97868 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbbp6P97868 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbbp6P97868 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbbp6P97868 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms