Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gfra1P97785 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gfra1P97785 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms