Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pitx2P97474 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms