Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dlx4P70436 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dlx4P70436 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms